Theo chỉ đạo của Phó Thủ tướng Chính phủ Lê Minh Khái, UBND TP.HCM đã hợp tác với Ban Tiếp công dân Trung ương và các cơ quan liên quan để tiếp đại diện của 5 khu phố thuộc 3 phường Bình An, Bình Khánh, An Khánh và thông báo kết quả kiểm tra, rà soát về ranh quy hoạch của Khu đô thị mới Thủ Thiêm.

Theo đó, dựa trên đề nghị của Thanh tra Chính phủ và ý kiến chỉ đạo của Phó Thủ tướng Thường trực Trương Hòa Bình, Thanh tra Chính phủ đã ban hành Thông báo số 1483 để báo cáo kết quả kiểm tra và xác minh về ranh quy hoạch của Khu đô thị mới Thủ Thiêm, bao gồm quy hoạch 1/5000 và quy hoạch chi tiết 1/2000; đồng thời liên quan đến việc thu hồi đất, bồi thường, hỗ trợ tái định cư và khu tái định cư với quy mô 160 ha.

Dù có các tồn tại và vi phạm được phát hiện thông qua quá trình kiểm tra và rà soát, Thanh tra Chính phủ đã kiến nghị Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo xử lý các vấn đề này. 

Tuy nhiên, do ý kiến không nhất trí từ phía người dân đối với kết luận về ranh quy hoạch nên Phó Thủ tướng Thường trực Chính phủ Trương Hòa Bình đã chỉ đạo Thanh tra Chính phủ chủ trì, phối hợp với Bộ Tài nguyên và Môi trường, Bộ Xây dựng, Bộ Tư pháp và UBND TP.HCM để kiểm tra các nội dung khiếu nại của một số hộ dân 5 khu phố liên quan đến ranh quy hoạch Khu đô thị mới Thủ Thiêm.

Theo Thanh tra Chính phủ, qua các buổi làm việc và căn cứ kết quả kiểm tra của Tổ Kiểm tra liên ngành cùng các hồ sơ, tài liệu và các bản đồ (bộ bản đồ do nguyên Chủ tịch UBND TP.HCM Võ Viết Thanh cung cấp; 2 bản đồ quy hoạch Khu đô thị mới Thủ Thiêm do các cơ quan của UBND TP.HCM cung cấp; bản đồ hành chính quận 2 và vị trí các thửa đất của các hộ dân), Thanh tra Chính phủ kết luận có đủ cơ sở để xác định vị trí, ranh giới, số thửa đất của các hộ dân đang khiếu nại thuộc 5 khu phố thuộc 3 phường nằm trong ranh quy hoạch thuộc Khu đô thị mới Thủ Thiêm. 

Dựa trên kết quả kiểm tra, Thanh tra Chính phủ chấp nhận đúng xác định ranh quy hoạch Khu đô thị mới Thủ Thiêm theo Thông báo số 1483/TB-TTCP, và các bản đồ quy hoạch 1/5000 từ UBND TP.HCM được coi là cơ sở chính xác. Bản đồ của Nguyên Chủ tịch UBND TP.HCM chỉ mang tính tham khảo. Thủ tướng Chính phủ cũng đã xác nhận sự đồng thuận này tại Văn bản số 2536/VPCP-V.I.

Thanh tra Chính phủ cũng xác định vị trí và ranh giới của các hộ dân khiếu nại nằm trong quy hoạch Khu đô thị mới Thủ Thiêm, thông qua đối chiếu với Bản đồ hành chính Quận 2 và các Quyết định thành lập Khu phố.

Về đề xuất tiếp tục thực hiện Thông báo số 1483/TB-TTCP và Thông báo số 1169/TB-TTCP, Thanh tra Chính phủ khẳng định tuân thủ ý kiến chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ. UBND TP.HCM và các cơ quan liên quan được yêu cầu chấp hành nội dung của Thanh tra Chính phủ và ý kiến chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ.

Thanh tra Chính phủ và Trưởng Ban Tiếp công dân Trung ương Nguyễn Hồng Điệp đều đề xuất UBND TP.HCM, các Bộ ngành, cơ quan liên quan và người dân tuân thủ thông báo của Thanh tra Chính phủ và ý kiến chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ.